ABINIT

ABINIT的主程序使用赝势和平面波。用密度泛函理论计算总能量、电荷密度、分子和周期性固体的电子结构；根据密度泛函计算的力与压强进行几何优化、分子动力学模；或根据密度泛函微扰理论生成动力学矩阵、波恩有效电荷、介电张量，以及其他的性质，以及许多其他的性质。激发态可以用含时密度泛函理论（对分子）或GW近似（多体微扰理论）计算。此外还提供了大量的工具程序。程序的基组库包括了元素周期表1-109号所有元素。 ABINIT适于固体物理，材料科学，化学和材料工程的研究，包括固体，分子，材料的表面，以及界面，如导体、半导体、绝缘体和金属。

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一、脚本模板

1. Slurm

   #!/bin/bash
   #SBATCH --nodes=1                   # 节点数量
   #SBATCH --ntasks-per-node=56        # 每个节点核心数量
   #SBATCH --ntasks=56                 # 总核心数
   #SBATCH --partition=g1_share        # 队列分区且必须指定正确分区
   #SBATCH --job-name=vasp             # 作业名称
   #SBATCH --output=vasp.%j.out        # 正常日志输出 (%j 参数值为 jobId)
   #SBATCH --error=vasp.%j.err         # 错误日志输出 (%j 参数值为 jobId)
   
   ##############################################
   #          Software Envrironment             #
   ##############################################
   unset I_MPI_PMI_LIBRARY                        # 取消默认mpi库，使用intel自带
   export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0   # intel 多节点作业所需修改参数
   module load intel/2022 intelmpi/2022           # intel 环境加载
   
   ##############################################
   #               Run job                      #
   ##############################################
   export OMP_NUM_THREADS=1
   
   abinit < tstring.files >log 
   

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二、编译

1. 环境加载

   module load intel/2022 intelmpi/2022
   

2. 解压并进入软件目录

   tar zxvf abinit-8.10.3.tar.gz && cd abinit-8.10.3 && mkdir build tarballs
   
   # 将LibXC 3.0.0，NetCDF 4.1.1和LAPACK for Abinit ≥ 6.10拷贝到tarballs中。
   
   # 进入build文件夹中
   # 在build中建立hostname.ac文件，内容如下：
   

   # ================================================================
   # Configuration file for ABINIT 8 compilation on COBALT
   # tested for Intel2015 + impi
   #
   # ================================================================
   #
   FC="mpiifort"
   CC="mpiicc"
   CXX="mpicxx"
   #
   enable_mpi="yes"
   enable_openmp="yes"
   #
   with_linalg_flavor="mkl+scalapack"
   with_linalg_libs=${SCALAPACK_LDFLAGS}
   #
   with_fft_flavor="fftw3"
   with_fft_incs="-I${MKL_INCDIR}"
   with_fft_libs=${MKL_LDFLAGS}
   #
   with_trio_flavor="netcdf"
   with_dft_flavor="libxc"
   

   #在build中执行configure如下：
   ../configure --with-tardir=~/software/abinit-8.10.3/tarball
   
   make mj56