VASP
VASP
全称Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。
请自行购买VASP license许可,下载和安装。如需协助安装或使用,请联系我们,附上课题组拥有VASP license的证明。
一、脚本模板
- Slurm
#!/bin/bash #SBATCH --nodes=1 # 节点数量 #SBATCH --ntasks-per-node=56 # 每个节点核心数量 #SBATCH --ntasks=56 # 总核心数 #SBATCH --partition=g1_share # 队列分区且必须指定正确分区 #SBATCH --job-name=vasp # 作业名称 #SBATCH --output=vasp.%j.out # 正常日志输出 (%j 参数值为 jobId) #SBATCH --error=vasp.%j.err # 错误日志输出 (%j 参数值为 jobId) ############################################## # Software Envrironment # ############################################## unset I_MPI_PMI_LIBRARY # 取消默认mpi库,使用intel自带 export I_MPI_JOB_RESPECT_PROCESS_PLACEMENT=0 # intel 多节点作业所需修改参数 module load intel/2022 intelmpi/2022 # intel 环境加载 ############################################## # Run job # ############################################## export OMP_NUM_THREADS=1 mpirun -hosts `scontrol show hostname $SLURM_JOB_NODELIST |tr '\n' ',' | head -c-1` -np $SLURM_NTASKS vasp_std
二、编译CPU版本
-
环境加载
module load intel/2022 intelmpi/2022
-
vasp5.4.4
$ tar xf vasp.5.4.4.tar.gz $ cd vasp.5.4.4 $ cp arch/makefile.include.linux_intel ./makefile.include $ make all # 编译完成后会在vasp.5.4.4的文件夹下的bin文件夹里生成vasp_gam、vasp_ncl、vasp_std三个可自行文件。
三、编译GPU版本(过时的,vasp官方在最新版本中已删除支持)
-
环境加载
module load intel/2022 intelmpi/2022
-
vasp5.4.4
tar xf vasp.5.4.4.tar.gz cd vasp.5.4.4 cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include
vim makefile.include # 修改 -openmp 为 -qopenmp #更改前: GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \ -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \ -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\" #更改后: GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_70,code=\"sm_70,compute_70\" 备注:vasp5.4.4最高能接受的GPU sm配置为70 根据实际情况修改 make gpu # GPU版本使用的时候需要载入cuda,高版本如2018的intel编译器编译时会报错
-
vasp6.1.2
tar xf vasp.6.1.2.tar.gz cd vasp.6.1.2 cp arch/makefile.include.linux_intel makefile.include vim makefile.include #更改前: GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \ -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \ -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\" #更改后: GENCODE_ARCH := -gencode=arch=compute_80,code=\"sm_80,compute_80\" #A100为sm为80 根据实际情况修改 make gpu # GPU版本使用的时候需要载入cuda,高版本如2018的intel编译器编译时会报错